دسترسی به منطقه حفاظت شده مراکان از طريق جاده ترانزيت تبريز به مرز بازرگان (از ايواوغلي تا قره ضیاالدین) ميسر مي شود. اين منطقه در ضلع شمالي جاده يادشده، واقع است و محدوده اي تا مرز ايران با جمهوري آذربايجان (حاشيه رودخانه ارس) را از سمت شمال در بر مي گيرد. بنابراين علاوه بر جاده يادشده، جاده قره ضیاالدین به شهرك مرزي ارس و همچنين جاده مرزي جلفا به شهرك ارس به ترتيب ضلع غربي و ضلع شمالي اين منطقه را تشكيل مي‌دهند.